Klimatizační jednotky musí instalovat kvalifikovaný montážní tým. Dodavatelé by měli mít osobní certifikáty pro chladicí zařízení (certifikáty F-Gas) a certifikáty pro elektroinstalace. Přenosné klimatizační jednotky jsou jediným typem zařízení, které může uživatel instalovat osobně. Při instalaci je však nutné dodržovat pokyny uvedené v přiloženém návodu k obsluze.
Instalace ostatních typů klimatizačních zařízení vyžaduje použití specializovaných nástrojů, jako je vakuová pumpa, manometry, lahve s chladivem, elektroměr, nářadí na rozválcování trubek a také profesionální vybavení pro vrtání otvorů. Chladicí spoje mezi jednotkami jsou tvořeny měděnými trubkami, které jsou chráněny tepelnou izolací o správné tloušťce. Je třeba mít na paměti, že během chlazení dochází ke kondenzaci vody uvnitř vnitřní jednotky, která musí být odváděna do kanalizace nebo směřována mimo místnost. Nejlepší způsob odvádění je gravitační, tj. potrubí pro odvod kondenzátu musí být šikmé. Někdy je to však technicky nemožné, což vyžaduje použití přídavného čerpadla pro odsávání kondenzátu. Venkovní jednotka klimatizačního zařízení je obvykle umístěna na balkoně nebo na fasádě, případně na střeše budovy. Při instalaci dbejte na zajištění servisního přístupu a dodržení odpovídajících vzdáleností od stěn a zábran uvedených v návodu k instalaci.
Nezapomeňte provádět pravidelné technické kontroly instalovaných klimatizačních zařízení (nejlépe dvakrát ročně). Některé jednotky by navíc měly být registrovány ve speciální databázi, ve kterém jsou v závislosti na množství chladiva evidovány i povinné kontroly. Informace o zařízeních potřebných pro registraci v této databázi by měli poskytnout kvalifikovaní technici instalující klimatizační jednotky.